Считаю важным периодически выполнять две несложные команды, ради обновления пакетов ОС
apt-get update
apt-get upgrade
При этом возможно увеличить список базы репозиториев, просто добавив источник в чудесный файлик /etc/apt/sources.list собственно, что я сделал с nginx и как итог он у меня чудесным образом обновляется вместе с MySQL, php и apache2 всего лишь с использованием двух вышеупомянутых команд.
Удачи!